ZRANB3 dans les populations africaines: nouveau locus de risque du diabète de type 2 identifié

Last Updated on

04 août 2019 – L’Afrique est considérée comme le berceau originel de toute l’humanité, à laquelle tous les humains peuvent retracer l’origine génétique. Cela peut être très intéressant dans le contexte de maladies dues à des prédispositions génétiques tant chez les populations africaines actuelles que chez toutes les populations descendantes d’origine africaine dans le monde.

Dans une étude très remarquable allant dans ce sens, une équipe de recherche menée par des chercheurs des instituts nationaux de la santé génotypés, dans le cadre de l’étude Africa America Diabetes Mellitus (AADM), quelque 18 millions de SNP autosomiques sur 2 343 participants du Nigeria, du Ghana ou Kenya avec diabète de type 2 (DT2) et 2889 contrôles non affectés appartenant aux mêmes populations et présentant des indices de masse corporelle moyens similaires. L’équipe a rapporté en ligne dans Nature Communications qu’elle avait déjà commencé avec une étude d’association pangénomique incluant plus de 5 200 personnes du Nigéria, du Ghana et du Kenya avec ou sans DT2. Ils y avaient identifié 32 loci liés au DT2 dans des études antérieures, principalement menées chez des individus d’ascendance européenne, ainsi qu’une nouvelle association impliquant un locus proche de ZRANB3, appartenant à la famille SNF2 d’ATPases ADN-dépendantes qui fonctionnent en réplication. réponse au stress et catalyser le remodelage des fourches de réplication bloquées. En plus des loci de risque DT2 déjà connus, les analyses ont mis en évidence deux SNP de ZRANB3, absents de la base de données 1000 Genomes Project (1KGP) et de la base de données d’agrégation du génome (GnomAD), suspectés d’être spécifiques à certaines populations africaines. Dans une analyse de validation incluant des cas de DT2 et des témoins appartenant à une population zouloue en Afrique du Sud, dont les fréquences de population des deux SNP étaient inférieures à celles de la cohorte AADM, l’équipe a noté des effets directionnels cohérents, bien que les liens avec le DT2 semblaient moins marqués.

Les résultats de cette étude démontrent en outre pourquoi il est important d’étudier toutes les populations humaines. Ce faisant, de nouvelles découvertes qui aideront non seulement une population spécifique, mais aussi des personnes du monde entier vont être faites. De plus, au début des études génomiques à grande échelle, l’effet des gènes découverts au moyen de tests statistiques n’était pas connu. Aujourd’hui, avec la disponibilité de nouveaux outils génomiques, une étape logique dans le cas présent consiste à se demander: que fait ZRANB3? Comment confère-t-il un risque de DT2 et par quels mécanismes agit-il? Ces mécanismes sont-ils uniques aux individus d’ascendance africaine? Quel est/sont le(s) phénotype(s) clinique(s) résultant? Dans l’ensemble, ce type d’études ne fournira à terme que les connaissances nécessaires pour que les résultats deviennent exploitables pour les patients en médecine theragenomic.

Ainsi, pour ces expériences fonctionnelles, l’équipe a utilisé le séquençage de l’ARN, l’inactivation de gènes à base de CRISPR-Cas9, ainsi que d’autres approches permettant de jouer avec l’expression de ZRANB3 dans un modèle de DT2 du pancréas du poisson zèbre. Les résultats de telles expériences ont indiqué que le nombre de cellules bêta produisant de l’insuline dans le pancréas diminuait à mesure que l’activité de ZRANB3 était abaissée, résultats confirmés par de petites expériences d’inhibition du gène basées sur l’ARN interférant chez la souris. S’ils sont confirmés chez l’homme, ces résultats pourraient indiquer que, dans les populations africaines touchées par ZRANB3, la régulation des cellules bêta productrices d’insuline pourrait être l’un des mécanismes à l’origine du DT2 et que, par conséquent, cette régulation pourrait devenir une cible d’intervention thérapeutique.

Lorsqu’ils ont recherché des associations de DT2 avec plus de 100 SNP impliqués dans la maladie par le passé, les chercheurs ont vérifié 32 de ces locus à risque dans les cas nigérian, ghanéen ou kenyan, parmi lesquels TCF7L2rs7903146, MCM6, DARS, DGKB, GTF3AP5-AGMO , IL23R / IL12RB2, SLC44A4. Un peu plus de locus à risque sont issus de la méta-analyse GWAS, qui comprenait des données pour près de 8 600 participants d’Africains, d’Afro-Américains et d’autres populations.

Print Friendly, PDF & Email

Tags : , , , , , , , ,
About the Author
thassodotcom Professeur de pharmacologie et de toxicologie. Expert en médecine théragenomique et personnalisé el le sécurité individualisé des médicaments. Expert dans pharmaco- et toxico-génétique. Expert en matière de sécurité humaine de médicaments, les produits chimiques, les polluants environnementaux, et des ingrédients alimentaires.

Leave a Reply

Optional: Social Subscribe/Login




avatar
  Subscribe  
Notify of

thasso: conditions

thasso: tweets

thasso poste: magasin

View my Flipboard Magazine.

thasso: catégories

thasso: archives

thasso: chat simple

Vous devez être un utilisateur inscrit pour participer à ce tchat.

  • How much sunshine causes melanoma? It's in your genes novembre 21, 2019
    Australian researchers from QIMR Berghofer Medical Research Institute have shown that 22 different genes help to determine how much sun exposure a person needs to receive before developing melanoma.
  • You can test your embryos for genetic defects, but designer babies aren't here just yet novembre 21, 2019
    Designer baby, anyone? A New Jersey startup company, Genomic Prediction, might be able to help you.
  • Researchers identify a molecular mechanism involved in Huntington's disease novembre 21, 2019
    Researchers from the Institute of Neurosciences of the University of Barcelona (UBNeuro) and the August Pi i Sunyer Biomedical Research Institute (IDIBAPS) described a mechanism, the increase of proteinaceous synthesis, which takes part in the degeneration of the type of neurons that are affected in Huntington's disease, a genetic neurodegenerative disease. These results, published in […]
  • New Alzheimer risk gene discovered novembre 21, 2019
    A new paper in the Journal of Neuropathology & Experimental Neurology finds a gene that may help explain a large part of the genetic risk for developing Alzheimer disease.
  • Team publishes findings on TAF1 syndrome novembre 21, 2019
    An international, multidisciplinary research team from more than 50 institutions, led by geneticist and psychiatrist Gholson Lyon, MD, Ph.D., of the New York State Office for People With Developmental Disabilities' (OPWDD) Institute for Basic Research in Developmental Disabilities (IBR), today announced publication of findings from its study of the rare disease TAF1 syndrome.
Top