Blockchain: la génomique au lieu des bitcoins

Last Updated on juillet 22, 2022 by Joseph Gut – thasso

22 juillet 2022 – La blockchain est une technologie numérique qui permet un enregistrement sécurisé et décentralisé des transactions qui est de plus en plus utilisée pour tout, des crypto-monnaies aux œuvres d’art. Mais la blockchain entre également ou est de plus en plus utilisée dans n’importe quel environnement, où des informations individuelles apparaissent et pourraient être partagées en toute sécurité avec d’autres. L’une de ces nouvelles utilisations de la blockchain pourrait être l’effet de levier de la technologie pour donner aux individus le contrôle de leurs propres génomes.

Fait intéressant, thasso avait déjà un article sur le potentiel de la technologie blockchain pour les individus célibataires pour présenter leurs patients personnels et leurs phénotypes cliniques au public intéressé, un processus appelé “phénotype broker” à l’époque. Un article récent dans le numéro du 29 juin du Journal Genome Biology s’étend sur ce concept pour impliquer les données génomiques d’individus uniques dans une approche similaire basée sur la blockchain.

L’idée/l’objectif principal de cette approche blockchain est de redonner la propriété des données génomiques à l’individu, selon l’équipe de recherche à l’origine de cette étude. Des millions de personnes à la recherche d’informations sur leur ascendance ou sur les risques médicaux ont déjà fait don de leurs informations génétiques à des sociétés commerciales privées. Qu’ils le sachent ou non, cependant, ils ont également abandonné le contrôle sur la façon dont ces informations sont utilisées ou vendues.

La nouvelle technologie, baptisée SAMchain, garantit que les informations génomiques individuelles restent sécurisées et sous le contrôle de l’individu. Étant donné que les informations ne peuvent pas être modifiées une fois qu’elles sont stockées dans des chaînes de blocs, la technologie protège également contre la corruption occasionnelle des données ADN stockées sur le cloud, où la plupart des informations génomiques sont désormais stockées sur de vastes réseaux d’ordinateurs. Les données génomiques font de plus en plus partie intégrante de la compréhension de la santé et des maladies humaines.

L’intégrité et la sécurité de ces données doivent être une priorité lors de la fourniture de solutions de stockage et d’analyse. La corruption, la modification ou la perte de génomes personnels pourraient créer des problèmes dans les soins aux patients et l’intégrité de la recherche à l’avenir.

Bien sûr, la technologie SAMchain pourrait également accélérer l’avancée d’une médecine véritablement personnalisée. Par exemple, les patients pourraient fournir un accès direct à leurs données génomiques aux médecins qui pourraient ensuite utiliser ces informations pour aider à diagnostiquer et à traiter des conditions médicales. Ils pourraient également autoriser les chercheurs médicaux à utiliser leurs informations génétiques dans le cadre de leurs recherches ou même à les vendre à des sociétés pharmaceutiques, c’est-à-dire dans une sorte de “génomes broker“.

Les chercheurs affirment que le développement de la technologie blockchain à des fins médicales a été entravé par un énorme obstacle : l’immense taille des données contenues dans notre ADN. Contrairement à une transaction financière facilitée par la blockchain, comme un échange de bitcoins, qui nécessite une quantité limitée de stockage de données, les données issues du séquençage d’un seul chromosome humain peuvent contenir des millions de « lectures » ou de courts fragments d’ADN. Les chercheurs impliqués dans la présente étude ont contourné ce problème en comparant l’ADN d’un individu à un génome de référence standard. Ils ne stockaient alors que les différences dans les blocs liés de la blockchain. Les blocs, à leur tour, ont été indexés d’une manière spéciale pour permettre une requête rapide.

Cependant, cette mesure en elle-même peut être discutable. Alors que d’un point de vue informatique, un génome de référence standard peut être acceptable, du point de vue de l’individualité humaine, la question se pose de savoir quel génome sera utilisé comme standard de référence ? Existe-t-il un « génome standard » ? Et à quoi se rapportent alors les différences stockées d’individus isolés ? Ces différences individuelles peuvent, bien sûr, être liées à des conditions avec des facteurs de risque génétiques connus, qui peuvent potentiellement informer les patients non seulement de leur risque personnel de développer une maladie, mais aussi aider à orienter les traitements pour les troubles existants.

La situation idéale serait d’avoir une combinaison d’un système de blockchain avec des données génomiques qui sont corrélées avec les données phénotypiques du patient (résultats) avec une indication du rapport de cotes (Odds ratio) de la corrélation d’un statut génétique et du statut phénotypique réel d’un patient, comme indiqué dans et éludé dans le post précédent de thasso. Il y a peut-être encore du chemin à parcourir.

Voir une séquence sur la blockchain et sa role en  génomique: